Evaluación cuantitativa de la producción de bioaerosol SARS-CoV-2

Evaluación cuantitativa de la producción de bioaerosol SARS-CoV-2

El contacto cercano entre individuos ha contribuido significativamente a la propagación intermitente del coronavirus 2 (SARS-CoV-2), síndrome respiratorio agudo severo, en todo el mundo.

Según los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) de los Estados Unidos, ‘contacto cercano’ se define como una persona que ha pasado al menos 15 minutos, durante un período de 24 horas, a menos de dos metros de una persona infectada con la enfermedad por coronavirus 2019 ( COVID-19). Esta definición de contacto cercano se ha vuelto ampliamente utilizada en encuestas de «contacto» y la determinación del riesgo promedio de contraer COVID-19 en entornos de atención médica y comunidades.

Stady: Quintoariación en la producción de bioaerosol SARS-CoV-2 en exhalado. Haber de imagen: eldar nurkovic / Shutterstock.com

Sin embargo, los investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de Stanford consideraron que la base experimental para esta ventana de tiempo específica es limitada. De hecho, los investigadores plantearon la hipótesis de que las características y acciones individuales, como hablar, también pueden influir en la precipitación general de bioaerosoles e influir en el riesgo de exposición durante esta ventana de tiempo. Para estudiar más a fondo esta hipótesis, los investigadores cuantificaron el SARS-CoV-2 a partir de muestras de aliento exhalado para determinar el efecto del habla y las características individuales en la diseminación del virus.

Sensibilidad de muestreo de máscara mejorada

La producción de bioaerosoles de SARS-CoV-2 por una persona infectada varía de un individuo a otro. Como resultado, la producción de aerosoles generalmente se calcula modelando estimaciones combinadas de concentraciones en hisopos de las vías respiratorias con datos sobre el volumen total de producción de gotas.

Este enfoque se ha utilizado en gran parte debido a la falta de una herramienta de muestreo de bioaerosoles flexible que pueda determinar directamente la variabilidad en la abundancia de bioaerosoles del SARS-CoV-2. Si bien el muestreo con máscara se ha explorado como un método de muestreo de bioaerosoles, los estudios preliminares han encontrado un enfoque para producir sensibilidades marginales.

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En un esfuerzo por mejorar la sensibilidad y recuperar muestras de mascarillas, un grupo de investigadores de la Universidad de Stanford desarrolló recientemente una nueva herramienta de muestreo de mascarillas para evaluar la variabilidad de bioaerosol dentro de los individuos. Después de medir y secuenciar el SARS-CoV-2 de las muestras de aliento exhalado, los investigadores utilizaron estos datos para investigar el efecto del habla y las características individuales en la precipitación del virus.

sobre estudiar

Para esta investigación, los investigadores desarrollaron un instrumento de muestreo de máscara que incluía máscaras N95 ajustadas que contenían una placa de Petri de 47 mm (mm) con un filtro de membrana gelatinosa. Se recolectaron un total de 141 muestras de mascarillas de 97 pacientes infectados con COVID-19 del Hospital de Stanford entre septiembre de 2020 y marzo de 2021.

Los pacientes fueron divididos en dos grupos. Mientras que el grupo A incluyó pacientes que usaron una máscara durante 30 minutos y se les pidió que hablaran o permanecieran en silencio, el grupo B consistió en pacientes a los que se les pidió que usaran dos máscaras durante 15 minutos cada uno. Mientras usaban la primera máscara, los participantes del grupo B no hablaron en absoluto; Sin embargo, mientras usaban la segunda máscara, hablaron con el entrevistador o un miembro de la familia.

Resultados

“Durante 15 minutos de ensamblaje, el total de copias virales capturadas por las máscaras varió significativamente, desde 0 a 5.0 × 106 Copiar mientras habla de 0 a 8,4 x 104 Copiar sin hablar.

Se informó una asociación moderada en las personas mayores que estaban en el grupo de habla de 15 minutos y cargas virales más altas en las muestras de aliento exhalado. Sin embargo, no se encontraron otros factores, incluida la duración de los síntomas, los días desde la primera prueba del SARS-CoV0-2 y el número de copias de RNAseP humana que afectan a las copias virales recolectadas en las máscaras. Es importante destacar que los pacientes hospitalizados tenían tasas de positividad de la máscara significativamente más bajas que los pacientes ambulatorios.

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(a) Los números de copias virales detectados en máscaras y frotis nasales se correlacionaron moderadamente en el grupo A (muestreo de 30 minutos sin instrucciones; azul, n = 33) y el grupo B (muestreo de 15 minutos; rojo, n = 44) grupo de habla. (NS) Número total de copias virales detectadas para cada muestra de máscara en la cohorte que habla y no habla. Las transcripciones virales se detectaron utilizando sondas N1 y N2 para SARS-CoV-2. La transcripción viral se midió en una curva estándar derivada del gen N que contiene el plásmido pET21b +.

Al secuenciar las muestras exhaladas, los investigadores evaluaron la calidad del ARN extraído de los filtros de la máscara y determinaron si las muestras de la máscara podrían usarse para el monitoreo genético. Con este fin, los investigadores encontraron que el 71% de todas las muestras de mascarillas cumplieron con sus objetivos de secuenciación de cobertura, lo que demuestra la posible aplicación del muestreo de bioaerosoles para la secuenciación del genoma completo de patógenos respiratorios. Por lo tanto, el muestreo de máscara es un método prometedor para estudiar la transmisión y detectar variantes.

(a) La mayoría del 71,4% (15/21) de todas las muestras de máscaras, incluidas el 62,5% (5/8) de máscaras, el 50,0% de las máscaras que no hablan y el 88,9% (8/9) de las muestras de máscaras que hablan, cumplieron con nuestros objetivos de profundidad. secuenciación de cobertura (100x) y ancho (> 90% del genoma con cobertura> 10x). (NS) La profundidad media de cobertura se asoció con la carga viral (r = 0,65, p <0,001).

conclusión

En el estudio actual, los investigadores desarrollaron una nueva herramienta de muestreo de máscara que se puede utilizar para identificar y secuenciar el material genético del SARS-CoV-2 a partir de muestras de aliento exhalado. Los datos presentados aquí también proporcionan evidencia de un efecto del habla y la variación interindividual en la eliminación del SARS-CoV-2 en aerosoles.

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El estudio se centró en un área no abordada de evaluación cuantitativa de la producción de bioaerosol SARS-CoV-2 y sus determinantes. Ayudan a informar la evaluación y clasificación de riesgos para exposiciones y transmisión de infecciones por bioaerosol, así como pautas para el contacto cercano. La exposición varía mucho entre las personas, pero puede dividirse en niveles de riesgo según la carga viral del hisopo nasal y si la exposición implica una conversación.

*Nota IMPORTANTE

medRxiv Publica informes científicos preliminares que no han sido revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.

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