Un estudio revela un gen que duplica el riesgo de muerte por COVID-19

Los investigadores del Departamento de Medicina de Radcliffe han identificado el gen responsable de duplicar el riesgo de insuficiencia respiratoria por COVID-19. El sesenta por ciento de las personas de ascendencia del sur de Asia son portadoras de señales genéticas de alto riesgo, lo que explica en parte el aumento excesivo de muertes observadas en algunas comunidades del Reino Unido y el impacto del COVID-19 en el subcontinente indio.

El trabajo anterior ya había identificado una extensión del ADN en el cromosoma 3 que duplicó el riesgo de muerte de los adultos menores de 65 años por COVID. Sin embargo, los científicos no sabían cómo funciona esta señal genética para aumentar el riesgo, ni el cambio genético exacto responsable.

En un estudio publicado en genética natural, un equipo dirigido por el Prof. James Davies y Jim Hughes del MRC Weatherall Institute for Molecular Medicine de la Universidad de Oxford utilizaron la última tecnología para averiguar qué gen causó el efecto y cómo lo estaba haciendo.

El coautor del estudio, el profesor Jim Hughes, profesor de regulación genética, dijo: «La razón por la que esto es tan difícil de precisar es que la señal genética previamente identificada afecta la» materia oscura «en el genoma. Descubrimos que el aumento del riesgo no se debió a la diferencia en la codificación genética de la proteína., pero debido a la diferencia en el ADN que hace el cambio para activar el gen. Es muy difícil detectar qué gen se ve afectado por este tipo de efecto de cambio indirecto «.

El equipo entrenó un algoritmo de inteligencia artificial para analizar cantidades masivas de datos genéticos de cientos de tipos de células de todas las partes del cuerpo, para mostrar que es probable que la señal genética afecte las células pulmonares. Luego, utilizando una tecnología de alta resolución que acaban de desarrollar, los investigadores pudieron reducir el tamaño del ADN con la señal genética. Esto examina la forma en que miles de millones de letras de ADN se pliegan para caber dentro de una célula y determinar qué gen específico estaba controlando la secuencia que causa un mayor riesgo de COVID-19 severo.

Dijo el Dr. Damien Downs, quien dirigió el trabajo de laboratorio del grupo de investigación de Hughes, dijo que era «sorprendente que, con la sospecha de tantos otros genes, los datos mostraran que un gen relativamente no estudiado llamado LZTFL1 está causando el efecto».

Los investigadores encontraron que la versión de alto riesgo del gen puede evitar que las células que recubren las vías respiratorias y los pulmones respondan adecuadamente al virus. Pero lo que es más importante, no afecta el sistema inmunológico, por lo que los investigadores esperan que las personas que portan este tipo de gen respondan normalmente a las vacunas.

Los investigadores también esperan que los medicamentos y otros tratamientos puedan apuntar a la vía que evita que el revestimiento del pulmón se transforme en células menos especializadas, lo que aumenta la posibilidad de nuevos tratamientos adaptados a las personas con mayor riesgo de desarrollar síntomas graves.

El co-líder del estudio, el profesor James Davies, que se ha desempeñado como consultor del NHS en medicina de cuidados intensivos durante la pandemia y profesor asociado de genómica en el Departamento de Medicina de la Universidad de Oxford, dijo: “El factor genético que descubrimos explica por qué algunos las personas desarrollan una enfermedad muy grave después de contraer el coronavirus. Explica que la forma en que los pulmones responden a la infección es fundamental, y esto es importante porque la mayoría de los tratamientos se han centrado en cambiar la forma en que el sistema inmunológico reacciona al virus.

El sesenta por ciento de las personas de ascendencia del sur de Asia portan esta versión de alto riesgo del gen en comparación con el 15 por ciento de las de ascendencia europea, lo que explica en parte las tasas más altas de mortalidad y hospitalización en el primer grupo. El estudio también encontró que el 2 por ciento de las personas de ascendencia afro-caribeña portan el genotipo de alto riesgo, lo que significa que este factor genético no explica completamente las tasas de mortalidad más altas reportadas para las comunidades étnicas minoritarias y negras.

El profesor Davies explicó: «El código de ADN de alto riesgo se encuentra más comúnmente en algunas comunidades étnicas minoritarias y negras, pero no en otras. Aunque no podemos cambiar nuestra genética, nuestros resultados muestran que las personas con genes de alto riesgo tienen más probabilidades de beneficiarse. Especialmente de la vacunación. Dado que la señal genética afecta al pulmón más que al sistema inmunológico, esto significa que la vacuna debe anular el aumento del riesgo «.