Desde el descubrimiento del síndrome respiratorio agudo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), han surgido varias variantes virales, algunas de las cuales han exhibido una virulencia y transmisibilidad superiores en comparación con la cepa original.
La Organización Mundial de la Salud (OMS) ha clasificado estas cepas más virulentas del SARS-CoV-2 como variantes de preocupación (VOC) o variantes de interés (VOI) de acuerdo con su infectividad, mutaciones, virulencia y capacidad para evadir las respuestas inmunitarias generadas. por inmunización o infección natural.
Estudio: Caracterización genómica y virológica de variantes de SARS-CoV-2 en un subconjunto de personal militar estadounidense vacunado y no vacunado. Haber de imagen: Emily C. McCormick/Shutterstock.com
Fondo
Hasta la fecha, se han identificado cinco COV del SARS-CoV-2, que incluyen B.1.1.7 (Alpha), B.1.351 (Beta), P.1 (Gamma), B.1.617.2 (Delta) y Cepas B.1.1.529 (Omicron). Recientemente, la variante Omicron se ha convertido en la cepa circulante dominante en la mayoría de los países del mundo.
Antes de la aparición de la variante Omicron, los científicos caracterizaron la variante Delta como más transmisible que la variante Alfa. Con este fin, los estudios indicaron que la variante Delta provocó un aumento de las tasas de hospitalización entre las personas no vacunadas.
La aparición de los COV del SARS-CoV-2 también ha aumentado los informes de infecciones por avance de la vacuna (IBV). Aunque la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa en tiempo real (qRT-PCR) ha demostrado ser extremadamente eficiente para detectar COVID-19, una de las limitaciones de este ensayo es que detecta el ácido ribonucleico viral en lugar del virus en sí. Esto es problemático, ya que las cargas virales estimadas por qRT-PCR no siempre se correlacionan con la cantidad de virus viable en una muestra determinada.
Dentro de un entorno de laboratorio, los científicos detectan virus infecciosos a través de in vitro cultivo viral en líneas celulares susceptibles. Aunque este método es efectivo y proporciona información relacionada con la eliminación viral, requiere mucha mano de obra y requiere instalaciones de nivel de bioseguridad 3 (BSL-3) cuando se manipula el SARS-CoV-2.
En general, las células Vero y sus subclones, como las células Vero E6 que expresan la serina proteasa 2 transmembrana humana (TMPRSS2), se usan comúnmente para cultivar el SARS-CoV-2. Los ensayos de dosis infecciosa de placa o cultivo tisular medio (TCID50) se utilizan para cuantificar virus viables.
Aunque varios estudios han descrito métodos para medir la cantidad de virus viable que excretan las personas infectadas con diversas variantes del SARS-CoV-2, se requiere más investigación para caracterizar los niveles de virus entre las personas vacunadas y no vacunadas. Esto es esencial, ya que diferentes estudios han seguido diferentes métodos y se han centrado en muestras variadas de diferentes ubicaciones geográficas.
Sobre el estudio
en un nuevo Fronteras en Medicina estudio, los investigadores discuten la caracterización genómica y virológica de las variantes del SARS-CoV-2 entre el personal militar de EE. UU. vacunado y no vacunado. Los autores evaluaron muestras de hisopos nasales que se recolectaron entre marzo de 2020 y principios de noviembre de 2021 de una cohorte de personal militar de EE. UU. y beneficiarios estacionados en todo el mundo como parte del programa de Vigilancia de infecciones emergentes globales (GEIS) de la Agencia de Salud de Defensa (DHA).
Las muestras positivas para SARS-Co-2 se determinaron y se sometieron a secuenciación de próxima generación. Los subconjuntos se analizaron para estimar virus viables.
Hallazgos del estudio
Una fracción significativa de los casos de VBI en el estudio actual se asoció con la variante Delta. Los investigadores observaron que el aumento de la transmisibilidad de esta variante se debió en parte a una mayor cantidad de excreción de virus.
Curiosamente, entre los VBI, los autores informaron un aumento de 50 veces en el virus viable en las muestras de hisopos nasales de los casos de la variante Delta en comparación con los casos que involucran otras variantes. De manera similar, se encontró un aumento de 40 veces en el virus viable en muestras de hisopos nasales de VBI que involucran a Delta en comparación con el personal no vacunado infectado con otras variantes.
Linajes Pango de cepas SARS-CoV-2 circulantes en el ejército de EE. UU. antes y después de la implementación de las vacunas EUA. (A) Distribución de los linajes de Pango por mes para todas las muestras, (B) distribución de los sublinajes de variantes Delta por mes, (C) gráfico apilado que muestra todos los linajes por mes y (D) gráfico apilado que muestra los sublinajes de variantes Delta por mes.
Las personas permanecieron sin vacunar porque, en ese momento, ninguna vacuna había recibido la aprobación de los organismos reguladores mundiales. Los hallazgos de este estudio están en línea con estudios previos que incluyeron al resto de la población en los EE. UU., donde la variante Delta era la cepa predominantemente circulante.
Los científicos informaron que la variante Delta contiene la mutación R203M, mientras que la variante Omicron contiene la mutación R203K, lo que podría ser la razón de la mayor aptitud de estas variantes. Investigaciones anteriores han indicado que las muestras de personas infectadas con la variante Delta mostraron mayores niveles de ARN viral y un período más largo de eliminación viral en comparación con las muestras obtenidas de personas infectadas con otras variantes.
Los investigadores también observaron niveles similares de ARN viral de individuos vacunados y no vacunados. En el futuro, se requieren más estudios para determinar la duración de la diseminación viral y la carga viral asociada con la variante Omicron.
Los científicos analizaron sus resultados entre los fabricantes de vacunas y detectaron niveles significativamente más altos de virus viable en muestras de personas que recibieron las vacunas de Pfizer y Johnson & Johnson. Se encontró que estas personas experimentaban más VBI debido a la infección por la variante Delta que el personal no vacunado con infecciones no Delta.
Conclusiones
Una de las limitaciones de este estudio fue la falta de disponibilidad de metadatos para las muestras clínicas. Esto dificultó la interpretación adecuada de los resultados con respecto a las diferencias de edad, condiciones preexistentes y días desde la exposición o el inicio de los síntomas.
Además, la cohorte de estudio incluyó personal militar joven entre las edades de 18 y 40 años que deben mantener las condiciones físicas adecuadas para su deber. Por lo tanto, la falta de diversidad también podría dar lugar a resultados sesgados.
El estudio actual ha enfatizado la importancia de caracterizar el genoma del SARS-CoV-2 y los títulos virales viables de todas las variantes emergentes del SARS-CoV-2 aisladas del personal vacunado y no vacunado.
Referencia de la revista:
- Smith, RD, Singh, C., Green, J., et al. (2022) Caracterización genómica y virológica de variantes de SARS-CoV-2 en un subconjunto de personal militar estadounidense vacunado y no vacunado. Fronteras en Medicina. doi:10.3389/fmed.2021.836658.
